Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 610373)
Контекстум
Вестник Московского университета. Серия 16. Биология  / №4 2010

Мультилокусное секвенирование - информативный подход молекулярной экологии (60,00 руб.)

0   0
Первый авторВоронина
АвторыКунда М.С., Лунин В.Г., Гинцбург А.Л.
Страниц4
ID466446
АннотацияПрименение мультилокусного секвенирования в исследовании штаммов легионелл, выделенных на территории России, позволило получить данные для молекулярно-экологического анализа сложившейся обстановки. Штаммы грунтовых вод показали сходные аллельные профили в разных удаленных регионах страны. Мутационные процессы в условиях градирен и в областях застоя воды автономной системы водоснабжения имели сходную направленность. При формировании клональных комплексов преобладал механизм рекомбинации. На основе сравнения аллельных профилей штаммов с базой данных EWGLI дана эпидемиологическая оценка изученных штаммов.
УДК577.29
Мультилокусное секвенирование - информативный подход молекулярной экологии / О.Л. Воронина [и др.] // Вестник Московского университета. Серия 16. Биология .— 2010 .— №4 .— С. 10-13 .— URL: https://rucont.ru/efd/466446 (дата обращения: 06.04.2025)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

4 УДК 577.29 МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕИНФОРМАТИВНЫЙ ПОДХОД МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭКОЛОГИИ О.Л. <...> Н.Ф. Гамалеи РАМН; e-mail: kirolg3@newmail.ru) Применение мультилокусного секвенирования в исследовании штаммов Legionella pneumophyla, выделенных на территории России, позволило получить данные для молекулярно-экологического анализа сложившейся обстановки. <...> Штаммы грунтовых вод показали сходные аллельные профили в разных удаленных регионах страны. <...> Мутационные процессы в условиях градирен и в областях застоя воды автономной системы водоснабжения имели сходную направленность. <...> При формировании клональных комплексов преобладал механизм рекомбинации. <...> На основе сравнения аллельных профилей штаммов с базой данных EWGLI дана эпидемиологическая оценка изученных штаммов. <...> Ключевые слова: мультилокусное секвенирование (MLST), аллельный профиль, клональный комплекс, изменение единичного локуса (SLV). <...> Мультилокусное секвенирование (Multi Locus Sequence Typing, MLST) — удобный инструмент молекулярной экологии, позволяющий различать штаммы одного вида микроорганизмов. <...> Контроль легионеллезной инфекции предполагает анализ состояния воды в централизованных и автономных системах водоснабжения, системах конденсации воды (градирнях). <...> Для эффективного контроля на базе Европейской рабочей группы по легионеллезу (The European Working Group for Legionella Infections, EWGLI) разработана схема MLST штаммов L. pneumophyla [2]. <...> Например, в 2007 г. схема была дополнена седьмой мишенью для секвенирования с целью увеличения ее дифференцирующей способности [3]. <...> Централизованный контроль результатов позволяет вводить проверенные новые аллели и аллельные профили. <...> Информация об эпидемической значимости штаммов, доступ к которой получают зарегистрированные пользователи, занимающиеся анализом штаммов L. pneumophyla, помогает в оценке штаммов, обнаруженных на контролируемом объекте. <...> В России схему MLST стали применять с 2007 г., прежде всего при расследовании вспышки легионеллеза в г. Верхняя Пышма Свердловской <...>