14 УДК 575.852.112:575.852.113:004.273 КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА АНАЛИЗА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭВОЛЮЦИИ ГЕНОВ И БЕЛКОВ: СООТНЕСЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЭВОЛЮЦИИ С ЭВОЛЮЦИЕЙ ФЕНОТИПИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ ОРГАНИЗМОВ К.В. <...> Колчанов1,2 ( 1Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, г. Новосибирск; 2Новосибирский государственный университет, г. Новосибирск; e-mail: genkvg@bionet.nsc.ru) Создана компьютерная система анализа молекулярной эволюции генов и белков SAMEM, основанная на анализе отношения частот фиксации радикальных аминокислотных замен к консервативным (KR/KC) и исследовании скоростей изменения физико-химических свойств аминокислот в эволюции белков (VP). <...> Для анализа используются все известные физикохимические свойства аминокислот и производится статистическое соотнесение изменения этих свойств с фенотипическими признаками организмов. <...> SAMEM доступна по адресу http://pixie.bionet.nsc.ru/samem/ Ключевые слова: молекулярная эволюция, радикальные и консервативные замены аминокислот, система клиент-сервер. <...> В последнее время адекватность использования отношения частот фиксации несинонимических замен к синонимическим для определения режима эволюции генов поставлена под сомнение [1, 2]. <...> В качестве альтернативы предлагаются анализ отношения частот фиксации радикальных аминокислотных замен к консервативным (KR/KC) [3] и анализ скоростей фиксации различных аминокислотных замен в эволюции белков (VP) [4]. <...> Недостатком этих подходов является априорная классификация замен по свойствам или типам аминокислот на радикальные или консервативные. <...> В качестве нулевой гипотезы TREESAAP 3.2 использует предположение о равновероятной частоте всех типов аминокислотных замен, что в эволюции белков часто не выполняется [6]. <...> Наш подход, как и TREESAAP, учитывает все известные физико-химические свойства аминокислот, но учитывает неравенство частот замен аминокислот аналогично методу [4]. <...> Кроме того, для соотнесения эволюционных изменений физико-химических свойств аминокислот <...>