4 УДК 577.212:004 КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ СХОДСТВА АССОЦИИРОВАННЫХ С МИКРОТРУБОЧКАМИ И КЛЕТОЧНЫМ ЦИКЛОМ СЕРИН-ТРЕОНИНОВЫХ ПРОТЕИНКИНАЗ ЧЕЛОВЕКА С ИХ РАСТИТЕЛЬНЫМИ ГОМОЛОГАМИ П.А. <...> Блюм1 ( 1ГУ Институт пищевой биотехнологии и геномики НАН Украины, г. Киев; 2Институт белка РАН, г. Москва; е-mail: karpov.p.a@gmail.com) Обнаружен 191 растительный гомолог протеинкиназ человека, принимающих участие в фосфорилировании белков микротрубочек и регуляции клеточного цикла. <...> Методом объединения соседей (NJ) проведен анализ сходства протеинкиназ. <...> Ряд белков цитоскелета (тубулины, белки, ассоциированные с микротрубочками типа I и др.) животных и высших растений демонстрируют значительное сходство [2—4], что дает основание рассчитывать на существование общих сайтов фосфорилирования и сходство связанных с ними протеинкиназ. <...> Ранее нами были отобраны 68 серин-треониновых протеинкиназ человека, формирующих кином микротрубочек и участвующих в регуляции клеточного цикла, а также показана возможность существования растительных гомологов для 30 из них [5]. <...> На основании гомологии каталитических доменов [6] было показано существование растительных гомологов протеинкиназ Aurora [7, 8], Ste20 [9] и MAST2 [10]. <...> В связи с этим целью данной работы являлась идентификация растительных протеинкиназ, ассоциированных с микротрубочками, на основании сходства последовательностей их киназных доменов и 30 протеинкиназ человека [5]. <...> Объекты и методы Последовательности протеинкиназ Homo sapiens были взяты из базы данных Swiss-Prot (www.expasy.org). BLASTp-сканирование базы данных UniProt осуществлялось против последовательностей каталитических доменов протеинкиназ человека [11]. <...> Отбор гомологов осуществлялся на основании процента идентичности последовательностей, процента сходства и значения E-value [12]. <...> Границы каталитических доменов определяли с применением сетевого инструмента SMART (http://smart.embl-heidelberg.de/). <...> Множественные выравнивания аминокислотных последовательностей выполняли с помощью <...>