10 БИОХИМИЯ УДК 577.214.39 МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ТРАНСКРИПЦИИ ХРОМАТИНА РНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ 3. <...> ЧАСТЬ 2 В.М. Студитский*, И.В. Орловский, О.В. Чертков, Н.С. Ефимова, М.А. Логинова, О.И. Кулаева* (лаборатория регуляции транскрипции и репликации, кафедра биоинженерии; e-mail: studitvm@umdnj.edu) Нуклеосома формирует “нуклеосомный барьер”, который представляет серьезное препятствие для транскрипционного аппарата. <...> Показано, что для транскрипции хроматина сходные механизмы используются очень разными полимеразами. <...> Приведены данные, свидетельствующие о сходстве механизмов транскрипционного и АТФзависимого ремоделирования хроматина. <...> В первой части обзора рассмотрена структура хроматина и общие принципы транскрипции ДНК, организованной в хроматин. <...> Нуклеосома, формируя “нуклеосомный барьер”, представляет серьезное препятствие для элонгационного комплекса. <...> В случае транскрипции РНК-полимеразой бактериофага SP6 “нуклеосомный барьер” изучали, используя короткие мононуклеосомные матрицы, позволяющие блокировать РНК-полимеразу в определенных положениях на нуклеосоме [1]. <...> Так, полимеразу блокировали в положении, где возникает пауза (42 п.н. от начала нуклеосомы), а также в положении еще до достижения ею нуклеосомного барьера (23 п.н.) <...> . Структуру интермедиатов, формирующихся в различных позициях на нуклеосоме, анализировали с помощью электронной криомикроскопии (ECM); эти данные сравнивали с данными биохимического анализа тех же проб. <...> 1: (a—f ) частицы с одним “хвостом” ДНК, в некоторых случаях (a, e, f ) комплекс полимераза-РНК находится вблизи октамера, в некоторых случаях между комплексом и октамером обнаруживается свободная ДНК (b—d). (g—j) Частицы с двумя “хвостами” ДНК. <...> Предполагаемые комплексы полимераза-РНК — электронно-плотные участки, указанные стрелками. (k, l) Частицы с одним “хвостом” ДНК, в которых участок ДНК, проксиNJ 08854, USA. <...> В статье сохранены стиль и орфография авторов. мальный промотору, связан с нуклеосомой; такая <...>