8 ГЕНЕТИКА УДК 575.852 ИЗУЧЕНИЕ ВСТАВОК ПРЯМЫХ ПОВТОРОВ В МИКРОЭВОЛЮЦИИ МИТОХОНДРИЙ И ПЛАСТИД РАСТЕНИЙ НА ОСНОВЕ КЛАСТЕРИЗАЦИИ БЕЛКОВ О.А. <...> Зверков*, Л.Ю. Русин, А.В. Селиверстов*, В.А. Любецкий* (лаборатория геносистематики; e-mail: zverkov@iitp.ru) На основе кластеризации пластидных белков трех обширных групп растений и водорослей исследованы вставки точных прямых повторов и длины повторяемых участков в пластомах и митохондриях семенных растений. <...> Предположено, что в ходе эволюции некодирующих участков ДНК прямые повторы часто возникают одномоментно, возможно, в результате репликативных ошибок, состоящих в удвоении участка ДНК. <...> Обсуждается роль таких дупликаций в эволюции пластома. <...> Ключевые слова: вставки точных прямых повторов, пластиды, митохондрии, семенные растения, микроэволюция некодирующих участков ДНК, кластеризация пластидных белков. <...> Широко рассматривается задача поиска в одном геноме неточных повторов некоторого участка ДНК (“слова”). <...> В [2] эта программа применена к пластому Phoenix dactylifera и в нем найдены 11 прямых и обратных неточных повторов с длиной повторяемого слова 30 п.н. <...> В [3] с помощью REPuter найдены прямые неточные повторы с длиной повторяемого слова от 10 до 100 п.н. в пластомах пяти видов рода Oenothera. <...> В [2] рассматриваются неточные повторы в двух видах рода Silene. <...> При секвенировании новых пластомов среди первичной информации о них обычно ищутся и неточные повторы слов [4—6]. <...> Можно привести много примеров такого типа результатов, в которых рассматриваются единичные геномы, в частности пластомы, и повторяемые слова не короткие (иначе возникает огромное перепредсказание), а повторы неточные (часто они имеют 90% точность). <...> В [7] на основе большого числа недавно секвенированных пластомов рассматривалась эволюция большого инвертированного повтора, что не связано с изучением прямых точных повторов слов, которые, как показывают, в частности, наши результаты, имеют сравнительно небольшую длину. <...> Работа [8] посвящена <...>